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第一水平：中国微生物所（即中科院微生物所）：微生物方孙首乱面水平相当高。
武汉病毒所（也是中科院的）：病毒方面的老一。
武汉大学：微生物方面在大学中绝对是一流。
江南大学：微生物的发酵芹兆方向无人能敌。
山东大学：微生物发酵及理论方面也是相当牛的。
华中农大、南京农大、中国农大农业院校的三巨头，微生物都有不错。
中山大学：微生物生物防治方面很好，有国家生防重点实验室。云南大学：放线菌方面研究很领先，有国家放线菌研究重点实验室。
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